Las funciones agrarias continúan manteniendo un pero más que importante en el conjunto de la estructura económica local. Así, y según datos del último censo agrario, la localidad cuenta con casi 2.000 ha de tierras de labor, lo que supone casi el 80% del total de la superficie municipal. El número de explotaciones agrarias alcanza las 40, la práctica totalidad de carácter familiar. En lo que respecta a los cultivos destaca la producción de herbáceos, con casi más de 1.600 ha ocupadas por cereales de invierno como la cebada o el trigo. El resto de la superficie agraria se destina a barbechos y retirada de tierras.

Por su parte, la cabaña de Fuentes también resulta importante superándose las 5.600 cabezas, siendo la cría de ovino la orientación ganadera más destacada, con 5.000 cabezas censadas.

La localidad de Fuentes Calientes destaca por ser uno de los municipios pioneros en la provincia de Teruel en materia de producción ecológica, con más de 300 ha (año 2007) inscritas en el Comité Aragonés de Agricultura Ecológica, contando además con una fabrica de piensos ecológicos y con la primera granja de porcino ecológica inscrita en la Denominación de Origen Jamón de Teruel.

El resto de actividades económicas presentes en la localidad se distribuyen entre 10 actividades distribuidas en los sectores industrial (1 actividades), energético (1), construcción (2) y servicios (6).